吉林省食品工程与食品安全工程研究中心依托吉林农业大学，隶属吉林省发展改革委员会。主要任务是以我省优势、特色食品资源为研究对象，采用先进的食品工程技术和食品生物技术开展以食品科学与工程领域中的重大关键技术为重点的食品制造新技术、新工艺和新产品研究攻关，解决产业化关键技术问题；开展食品原料生产、加工过程以及食品物流等的全程质量控制与安全性评价关键技术研究，建立建全食品质量快速检测和安全评价体系，促进我省食品产业国际化、标准化建设。响应国家“创新产学研结合机制和模式，构建产业技术创新战略联盟”的号召，尽快实现省委第九次党代会提出的“农产品加工业向终端产品领域和资源效益最大化方向发展，建立国内领先、具有国际竞争力的农产品工业基地”战略目标，促进我省食品工业的健康、快速发展，为我省经济和社会发展做出应有的贡献。
中心目前拥有实验室面积2800m2，具有完备的专业实验室及现代化办公条件。中心设有畜产食品加工、粮油加工、生物化工、农产品贮藏加工、食品分析与检验、食品安全评价6个一级实验室，以及肉制品加工、粮油深加工、乳品与饮料中试车间3个校内中试基地。拥有万元以上先进的仪器设备112台（套），设备原值1400余万元。
中心学术带头人吉林农业大学博士生导师胡耀辉教授，研发团队现有31人，其中教授10人，副教授13人，博士21人。近四年来已培养出具有良好科研素质和科研能力的博士研究生5人，硕士研究生124人；在读博士、硕士研究生154人。“十五”以来，为我省食品行业输送了大批高层次人才和高技术成果，为我省食品行业发展起到了重要支撑作用，成为不可或缺的科技支撑体系。
目前确定了以玉米深加工、大豆深加工、畜产品加工、其它农产品加工和开发、果蔬储藏与加工技术开发、长白山野生资源综合利用、食用菌高附加值综合利用产业化技术的研究和食品包装技术及包装评估与检测技术研究等研究方向。在以玉米为原料发酵生产功能性糖醇、玉米蛋白肽、氨基酸、玉米、餐桌食品、玉米副产物高附加值转化利用与产品开发研究和发酵乳制品、发酵肉制品、食品中残留有害物质的生殖发育毒性和循环毒性等方面达到国内领先水平；在长白山林蛙活性成分研究和功能性食品研究与开发方面达到了国际领先水平。
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