食品科学与工程学院始建于1984年。有食品科学与工程一级学科博士后科研流动站，食品科学与工程一级博士学位授权学科，食品科学与工程和轻工技术与工程2个一级硕士学位授权学科，有食品科学、农产品加工及贮藏工程、粮食油脂及植物蛋白工程、食品安全与控制、水产品加工及贮藏工程、发酵工程、制糖工程、粮油生物转化8个二级硕士学位授权学科，有食品加工与安全和食品工程2个专业硕士学位点。食品科学与工程学科为吉林省“十二五”优势特色重点学科和吉林省特色高水平建设学科。基本覆盖了国内食品学院拥有的学科。学院有食品科学与工程、粮食工程和食品质量与安全和酿酒工程4个本科专业，其中食品科学与工程专业为国家特色专业、吉林省高校“十二五”特色专业和品牌专业，吉林省一流本科专业和国家一流本科建设专业。学院2018年实行大类招生培养，即按大类名称“食品科学与工程类”统一招生，前3个学期进行大类培养，第4学期（大二下学期）开始，按照学生意愿和学习成绩分专业。学院可以实现本、硕、博的连续培养。

学院现有教职工77人，其中专任教师60人，有教授19人，副教授25人，有49名教师具有博士学位；博士生导师15人，硕士生导师87人（含外聘导师39人）；先后获得国家新世纪百千万人才工程、国家有突出贡献中青年专家、全国优秀科技工作者、吉林省高级专家、吉林省拔尖创新人才、长白山学者特聘教授、省有突出贡献中青年专家、省优秀教师、省师德先进个人，省教学名师等各类人才荣誉称号36人次。学院师资力量雄厚，梯队结构、学缘结构和年龄结构合理。

学院现有食品科学与工程专业基础、食品科学与工程、食品质量与安全、粮食工程、酿酒工程5个系，6个教学团队，7个课程组，设有本科生实践教学中心1个，包括畜产食品加工、粮油深加工、粮食贮藏、乳饮品加工、啤酒生产、葡萄酒生产和主食产品生产等7个中试车间和学院公共平台1个；拥有教育部农科教合作人才培养基地1个，省级实践教学基地1个，校外实践教学基地36个。学院现有国家发改委“小麦和玉米深加工国家工程实验室（长春）”、教育部“动物生产与产品质量安全重点实验室”、农业部“国家玉米产业技术体系玉米深加工功能研究室”、农业部“国家大豆产业技术研发中心和玉米产业技术研究中心—加工研究室”、吉林省教育厅“农产品深加工重点实验室”农产品深加工省级重点实验室、吉林省食品工程与食品安全工程研究中心、吉林省食品生物制造科技创新中心等10个国家和省部级科研平台。实验室面积10000平方米，仪器设备总值8000多万元，拥有10万元以上大型仪器设备100余台套。为人才培养和科学研究提供了良好的硬件支撑。

学院有国家级“玉米和杂粮精深加工技术创新与产业化应用创新团队”、“国家粮食行业领军人才创新团队”吉林省“玉米主食工业化生产关键技术及产业化示范”重大项目研发团队，吉林省“玉米精深加工与功能性食品”、“玉米生物高效转化及精深加工”、“农副产品高附加值开发”、“玉米生物转化关键技术研究与功能性食品开发”、“国家玉米产业技术体系玉米深加工功能研究室研发团队”等8个国家和省部级创新团队。

学院十分重视并大力发展国内外学术交流合作，目前学院与美国普渡大学、路易斯维尔大学、密西西比州立大学、佛罗里达大学、佛蒙特大学，波兰波兹南大学，加拿大阿尔伯塔大学，日本麻布大学、岩手大学，韩国庆熙大学、韩国交通大学、韩国春川发酵研究院，俄罗斯圣彼德堡生物技术大学，乌克兰食品工程大学、乌曼农业大学等多个国家的高校及科研院所建立了合作关系。

学院紧紧围绕国家和地方农产品(食品)精深加工的重大技术需求，针对产业和行业发展的重要技术问题，形成了以粮食深加工与高值化利用、畜产食品加工新技术、农产品深加工与新资源利用和食品质量控制与安全评价等主要研究方向。先后主持“十三五”国家重点研发专项、国家自然科学基金、国家“863”计划、国家科技支撑计划、国家公益性行业科技专项、吉林省重大科技攻关项目等国家和省部级重大、重点项目159项。取得国家和省部级科技成果95项，获得国家科技进步二等奖1项，农业部中华农业科技成果一等奖1项，吉林省科技进步一等奖7项、二等奖9项、三等奖6项。在国内外学术期刊发表包括SCI和EI收录论文在内的学术论文450篇。获得国家发明专利133项。学院积极开展科研成果转化与推广应用工作，多年来转让推广技术成果45项，为企业创造经济效益20多亿元。